Руководство по форматам
Расширенный многокадровый DICOM (КТ и МРТ) на iPhone и iPad
В расширенном DICOM вся серия КТ или МРТ, а иногда и несколько серий, хранится в одном многокадровом файле с данными о положении и калибровке каждого кадра. Ossidex считывает эти данные, применяет правильное масштабирование к каждому кадру, разделяет серии с несколькими объёмами и серии 4D на отдельные объёма и открывает их в режимах 2D, MPR и 3D.
Классический и расширенный форматы
| Классический | Расширенный многокадровый | |
|---|---|---|
| Файлов в серии | Один файл на срез | Один файл на множество кадров |
| Геометрия | В заголовке каждого файла | В функциональных группах каждого кадра |
| Типичные источники | Большинство исследований КТ и МРТ, экспорт КЛКТ | Новые сканеры КТ и МРТ, экспорт некоторых систем КЛКТ (например, в виде одного многокадрового файла) |
Что поддерживает Ossidex
- Положение и ориентация каждого кадра — для правильного построения MPR и 3D.
- Масштабирование каждого кадра для корректного отображения единиц Хаунсфилда в КТ.
- Разделение нескольких стеков или временных точек в одном файле на отдельные объёма, в том числе классических серий 4D.
- Большие многокадровые файлы кэшируются после первой обработки.
Стоматологическая КЛКТ
Некоторые программы для КЛКТ экспортируют данные в один многокадровый DICOM-файл — например, Planmeca Romexis рекомендует такой вариант. Ossidex открывает как один многокадровый файл, так и вариант «набор однофреймовых файлов». Параметры экспорта Romexis.
Расширенный и классический форматы: что меняется для вас
| Классический (однофреймовый) | Расширенный (многокадровый) | |
|---|---|---|
| Копирование и обмен | Сотни файлов — некоторые легко потерять | Один файл — ничего не потеряется |
| Скорость импорта | Множество операций чтения небольших файлов | Одно чтение большого файла, затем — из кэша |
| Метаданные | Повторяются в каждом файле | Общие и покадровые группы |
| Поддержка в старых просмотрщиках | Универсальная | Иногда отсутствует — Ossidex читает оба формата |
Как определить расширенный DICOM
- Вместо сотен небольших файлов серия представлена одним большим файлом (десятки или сотни мегабайт).
- SOP Class — «Enhanced CT Image Storage», «Enhanced MR Image Storage» или другой похожий многокадровый класс.
- В просмотрщике тегов DICOM указано «Number of Frames» больше единицы и присутствуют функциональные группы отдельных кадров.
Перед импортом ничего проверять не нужно — Ossidex определяет формат автоматически.
Почему важна покадровая калибровка
В расширенной КТ для каждого кадра могут задаваться собственные коэффициенты масштабирования — slope и intercept. Если применить одни и те же значения ко всем кадрам, для некоторых срезов единицы Хаунсфилда будут рассчитаны неверно, что может повлиять на оценку плотности и настройки окон. Ossidex отдельно применяет калибровку каждого кадра и кэширует его заголовки, чтобы большие файлы быстрее открывались повторно.
Файлы с несколькими стеками и 4D
Некоторые расширенные файлы содержат несколько стеков (например, с разными реконструкциями) или несколько временных точек одной и той же области тела. Ossidex разделяет их на отдельные объёма, чтобы MPR и 3D строились на основе одного согласованного стека. Классические серии 4D из нескольких файлов (например, при диффузионной съёмке) разделяются таким же образом.
Советы по импорту
- Импортируйте файл как есть — преобразовывать его в классический DICOM не нужно.
- Если файл находится в ZIP-архиве, импортируйте архив — он будет распакован автоматически.
- Для очень больших файлов необходимо свободное место для кэшированного объёма. Освободите на устройстве несколько гигабайт.
В последних версиях также устранены самые распространённые проблемы с открытием данных с дисков. Если вместо снимков выбрать программу просмотра для Windows, находящуюся на диске (.exe), Ossidex предложит импортировать всю папку. Также импортируются DICOM-файлы без уникальных идентификаторов (UID) и JPEG-изображения без расширения файла; вспомогательные файлы программы просмотра с диска больше не вызывают запрос пароля.
Часто задаваемые вопросы
Нужно ли сначала преобразовать расширенный DICOM?
Нет. Импортируйте его как есть.
Мой файл экспорта КЛКТ — один огромный файл .dcm. Это расширенный DICOM?
Часто — да: несколько программ для КЛКТ экспортируют весь объём в один многокадровый файл. Импортируйте его напрямую: он сразу откроется в режиме 2D, а в режимах MPR, 3D и «дуга» — с Pro.
Почему при первом открытии требуется больше времени?
При первом открытии объём декодируется и кэшируется. При повторном открытии того же исследования используется кэш, поэтому оно загружается намного быстрее.
Работает ли расширенный DICOM в режимах MPR и 3D?
Да. После разделения на согласованные объёма расширенные серии открываются в режимах MPR и 3D (Pro — для ваших собственных исследований).
Можно ли экспортировать расширенный DICOM в виде изображений?
Да — текущий вид или серию можно экспортировать как изображения JPEG или файл PDF.
Источники
Related pages
Что такое файл DICOM? Объяснение формата медицинских изображений
DICOM — стандартный формат КТ, МРТ и рентгеновских снимков. Узнайте, что хранится в файле, как устроены исследования и серии и как открыть DICOM.
Planmeca Romexis
Открывайте экспорт DICOM и диски пациентов, созданные в Romexis Viewer.
МПР и 3D-реконструкция на iPhone и iPad
МПР со связанными перекрестиями, наклонными плоскостями и MIP слоя, а также 3D-визуализация объёма с предустановками и отсечением для КТ, КЛКТ и МРТ.
Как Ossidex читает и отображает DICOM на iPhone и iPad
Как Ossidex декодирует DICOM, JPEG 2000 и HTJ2K, собирает объёма для MPR и 3D и отображает их с помощью Metal на iPhone и iPad — всё на устройстве.