Справочник по форматам

Что такое файл DICOM? Объяснение формата медицинских изображений

DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine — цифровые изображения и коммуникации в медицине) — международный стандарт хранения и обмена медицинскими изображениями. Файл DICOM содержит пиксели изображения и заголовок со сведениями о пациенте, исследовании и сканере, например шагом пикселя и положением среза. Благодаря этому просмотрщик может выполнять измерения в миллиметрах и восстанавливать трёхмерные объёмы.

Загрузить в App StoreБесплатная загрузка · iPhone и iPad · iOS 17+

Что хранится в файле DICOM

  • Заголовок (элементы данных) — теги, такие как имя пациента (0010,0010), дата исследования, модальность, шаг пикселя, толщина среза и положение изображения.
  • Пиксельные данные — само изображение, без сжатия или со сжатием (JPEG, JPEG 2000, JPEG-LS, RLE…).
  • Уникальные идентификаторы (UID) — связывают каждое изображение с соответствующими серией и исследованием.

Исследования, серии и изображения

Одно исследование — это одно обследование (например, «КЛКТ верхней челюсти, 12 марта»). Оно включает одну или несколько серий — например, КТ может содержать реконструкции мягких тканей и костей, а МРТ — отдельную серию для каждой последовательности (T1, T2, FLAIR…). Каждая серия представляет собой набор изображений (срезов). Серия КТ из 400 срезов часто состоит из 400 отдельных файлов, иногда вообще без расширения.

Какие расширения файлов встречаются

Что вы видитеЧто это значит
.dcm / .dicomФайл изображения DICOM
Файлы без расширения (IM00001, 1.2.840…)Обычно это тоже DICOM — часто встречается на дисках
DICOMDIRСодержание диска: какие файлы относятся к пациенту, исследованию и серии
.nii / .nii.gzNIfTI — исследовательский формат для объёмных данных. Это не DICOM, но Ossidex его открывает

Как открыть файл DICOM

На компьютере понадобится DICOM-просмотрщик: приложения для фотографий не умеют читать этот формат. На iPhone или iPad установите Ossidex, сохраните файл в приложении «Файлы» (или используйте ссылку, по которой он был получен) и импортируйте его. Пошаговая инструкция.

Конфиденциальность

В заголовке содержатся сведения о пациенте, поэтому делитесь файлами DICOM осторожно. Ossidex позволяет экспортировать анонимизированную копию.

Основные теги DICOM и их назначение

ТегНазваниеДля чего просмотрщик использует этот тег
(0008,0060)МодальностьCT, MR, CR, DX, PX, IO… — выбор предустановок и инструментов
(0020,000D) / (0020,000E)UID экземпляра исследования / серииГруппирует файлы по исследованиям и сериям
(0020,0032) / (0020,0037)Положение / ориентация изображенияУпорядочивает срезы и формирует трёхмерные объёмы
(0028,0030)Шаг пикселяПереводит пиксели в миллиметры для выполнения измерений
(0018,0050)Толщина срезаУказывается для серии; влияет на качество MPR
(0028,1052) / (0028,1053)Смещение / коэффициент масштабированияПреобразуют сохранённые значения в единицы Хаунсфилда для КТ
(0028,1050) / (0028,1051)Центр / ширина окнаЗначения яркости и контрастности по умолчанию

Сжатие в DICOM

Пиксельные данные могут храниться без сжатия или сжиматься с использованием синтаксиса передачи: JPEG Baseline, JPEG Lossless, JPEG-LS, JPEG 2000, HTJ2K или RLE. На дисках с КЛКТ из стоматологических клиник и центров визуализации часто используется JPEG 2000 или JPEG Lossless, чтобы поместить данные на компакт-диск. Ossidex декодирует все эти форматы на устройстве; полный список приведён на странице форматов.

Если файлы DICOM «повреждены»

Не каждый файл с пометкой DICOM соответствует стандарту. Некоторые программы записи дисков не добавляют преамбулу длиной 128 байт, некоторые программы экспорта пропускают UID, а некоторые сохраняют JPEG-снимки рядом с изображениями. Ossidex распознаёт DICOM по содержимому, а не по имени файла, и восстанавливает такие файлы, если это позволяют данные.

В последних версиях также устранены наиболее распространённые проблемы, из-за которых не открываются настоящие диски: если вместо изображений выбрать программу просмотра для Windows, записанную на диск (.exe), Ossidex предложит импортировать всю папку; файлы DICOM без уникальных идентификаторов (UID) и изображения JPEG без расширения по-прежнему импортируются; вспомогательные файлы, входящие в комплект программы просмотра на диске, больше не вызывают запрос пароля.

Часто задаваемые вопросы

Можно ли преобразовать DICOM в JPG?

Да. Ossidex экспортирует текущий вид или всю серию в виде изображений JPEG или PDF. В JPEG не сохраняются медицинские метаданные, поэтому храните исходные файлы DICOM.

Почему на моём диске сотни файлов?

В сериях КТ и МРТ обычно один срез сохраняется в отдельном файле. Просмотрщик объединяет их в серию.

DICOM и DICOMDIR — это одно и то же?

Нет. DICOMDIR — это индексный файл со ссылками на изображения DICOM на диске. Подробнее о DICOMDIR.

DICOM используется только в радиологии?

Нет. DICOM применяется также в стоматологии (КЛКТ, панорамные и внутриротовые рентгеновские снимки), кардиологии, офтальмологии и ветеринарной визуализации.

Может ли файл DICOM содержать PDF?

Да. Объекты Encapsulated PDF содержат отчёты. Ossidex сохраняет их в составе исследования.

Источники

Related pages

Скачать приложение — бесплатно