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Visualizador NIfTI para iPhone e iPad: abra arquivos .nii e .nii.gz

O Ossidex abre arquivos NIfTI-1 (.nii e .nii.gz comprimido com gzip) no iPhone e iPad. Ele aplica a orientação gravada no arquivo, inclusive afins com cisalhamento, mostra o volume em 2D, MPR e 3D e exibe mapas de rótulos e máscaras de segmentação como camadas que você pode ativar por segmento.

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Volume de ressonância magnética exibido em painéis vinculados no Ossidex no iPad

O que é NIfTI

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) é um formato de pesquisa para dados volumétricos, muito usado em neuroimagem e em pipelines de aprendizado de máquina (por exemplo, resultados de segmentação). Diferente do DICOM, um único arquivo .nii guarda o volume inteiro e um cabeçalho compacto com tamanho do voxel e orientação, mas poucos dados do paciente ou do aparelho.

Suporte

RecursoStatus
NIfTI-1 .nii e .nii.gzSim
Orientação a partir de sform/qform, inclusive cisalhamentoSim
Mapas de rótulos / máscaras como camadas sobrepostasSim
Visibilidade por segmentoSim
NIfTI-2Ainda não
NIfTI 4D e sobreposições em ponto flutuanteAinda não

Abrir um arquivo NIfTI

  1. Salve o arquivo. Coloque o .nii ou .nii.gz (e os arquivos de máscara, se houver) no app Arquivos, ou compartilhe um link.
  2. Importe. Toque em + → Arquivos no Ossidex e selecione os arquivos.
  3. Visualize. O volume abre; as máscaras aparecem como camadas, com um botão para cada segmento.

NIfTI vs DICOM: visão geral

DICOMNIfTI-1
Uso típicoImagem clínica e arquivamentoPesquisa, análise, pipelines de IA
Arquivos por volumeMuitas vezes um por corteUm arquivo (.nii ou .nii.gz)
Metadados do paciente e do exameExtensosMínimos
OrientaçãoTags de posição/orientação por imagemMatrizes qform/sform
SegmentaçõesDICOM SEG, RTSTRUCTVolumes de mapa de rótulos

Visualizadores NIfTI por plataforma

VisualizadorPlataformaPreçoIndicado para
MRIcroGLWindows, macOS, LinuxGratuitoVisualização e renderização rápidas de volumes de pesquisa
ITK-SNAPWindows, macOS, LinuxGratuito, código abertoSegmentação manual e semiautomática
3D SlicerWindows, macOS, LinuxGratuito, código abertoSegmentação, registro e análise
FSLeyesmacOS, Linux (parte do FSL)Gratuito para uso não comercialResultados de análises de neuroimagem
NiiVue / PapayaNavegador webGratuito, código abertoVisualizar no navegador sem instalar nada
OssidexiPhone, iPadDownload gratuito; Pro para MPR e 3DVer volumes e máscaras no celular ou tablet

As ferramentas de pesquisa para desktop continuam sendo o lugar certo para análises; o Ossidex serve para olhar um volume ou uma segmentação longe do computador.

Abrindo NIfTI passo a passo no iPad

  1. Reúna os arquivos. Coloque o volume da imagem e os arquivos de máscara em uma mesma pasta no app Arquivos, ou compacte-os.
  2. Importe a pasta. Toque em + → Arquivos no Ossidex e selecione a pasta ou o ZIP.
  3. Ative os segmentos. Abra o painel de camadas para mostrar ou ocultar cada estrutura rotulada sobre a imagem.

Origens típicas de arquivos NIfTI

OrigemExemplo
Pesquisa em neuroimagemRM de crânio convertida de DICOM com dcm2niix
Ferramentas de segmentaçãoMapas de rótulos do 3D Slicer, ITK-SNAP ou nnU-Net
Conjuntos de dados públicosDatasets de desafios e coleções abertas de pesquisa
Pipelines de IASaídas de modelos salvas como máscaras ao lado do volume de entrada

Máscaras como camadas

Importe o volume da imagem junto com os arquivos de máscara. O Ossidex reconhece mapas de rótulos e os mostra como sobreposições coloridas; cada segmento tem seu próprio botão de visibilidade, para você mostrar uma estrutura de cada vez. As máscaras seguem a mesma orientação do volume, inclusive afins com cisalhamento — é aí que muitos visualizadores simples desenham as sobreposições no lugar errado.

Orientação, em poucas palavras

O cabeçalho NIfTI guarda como os índices dos voxels correspondem ao espaço do paciente (as matrizes qform e sform). Visualizadores que as ignoram mostram o volume invertido ou girado. O Ossidex aplica a transformação gravada e rotula as direções (esquerda/direita, anterior/posterior, superior/inferior) de acordo.

Limites

Os arquivos NIfTI contêm poucos metadados clínicos — sem nome do paciente, data do exame ou dados do aparelho —, então o exame aparece com o nome do arquivo. NIfTI-2, séries temporais 4D e mapas de sobreposição em ponto flutuante ainda não são suportados.

Perguntas frequentes

Posso ver uma segmentação do 3D Slicer ou do nnU-Net?

Se ela estiver salva como mapa de rótulos NIfTI-1, sim — aparece como camada sobre o volume da imagem.

NIfTI é melhor que DICOM?

Eles têm finalidades diferentes: o DICOM é o padrão clínico com metadados completos; o NIfTI é um formato de pesquisa compacto.

Posso medir em volumes NIfTI?

Sim. As distâncias usam o tamanho do voxel gravado no cabeçalho NIfTI, em milímetros, nos cortes e nos planos de MPR.

Como obtenho arquivos NIfTI a partir de DICOM?

Ferramentas de pesquisa como o dcm2niix convertem séries DICOM em NIfTI. Para visualização clínica, não é preciso converter — o Ossidex abre o DICOM original.

Posso converter NIfTI de volta para DICOM no Ossidex?

Não. O Ossidex abre NIfTI para visualização e exporta imagens ou PDF, não DICOM.

O .nii.gz precisa ser descompactado antes?

Não. O NIfTI comprimido com gzip é lido diretamente.

Fontes

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