Guía de formatos
Visor NIfTI para iPhone y iPad: abre archivos .nii y .nii.gz
Ossidex abre volúmenes NIfTI-1 y NIfTI-2 de un solo archivo (.nii y .nii.gz comprimidos con gzip) en iPhone y iPad. Visualiza volúmenes de RM u otros volúmenes escalares en 2D, MPR y 3D; selecciona puntos temporales en archivos 4D compatibles e inspecciona mapas de etiquetas o superposiciones continuas en planos 2D/MPR. La aplicación utiliza la transformación espacial almacenada; las cuadrículas sesgadas se remuestrean durante la importación. Estas herramientas NIfTI están en la aplicación, no en el visor del navegador.
Qué es NIfTI
NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) es un formato de investigación para datos volumétricos, muy utilizado en neuroimagen y en flujos de trabajo de aprendizaje automático (por ejemplo, para resultados de segmentación). A diferencia de DICOM, un archivo .nii contiene todo el volumen y un encabezado compacto con el tamaño y la orientación de los vóxeles, pero ofrece pocos detalles sobre el paciente o el escáner.
Compatibilidad
| Característica | Estado |
|---|---|
| NIfTI-1 y NIfTI-2 de un solo archivo .nii / .nii.gz | Sí |
| Orientación de sform/qform | Se aplica; las cuadrículas sesgadas se remuestrean |
| Series temporales escalares 4D | Selección de fotogramas y gráfico temporal del vóxel en el punto de mira |
| Mapas de etiquetas / máscaras | ID enteros exactos de 0 a 4095; visibilidad por segmento |
| Superposiciones continuas de punto flotante | Mapas de color, opacidad y umbrales |
| Ubicación de las superposiciones | Hasta dos capas seleccionadas en planos 2D/MPR; las fuentes deben estar ya alineadas espacialmente |
Abrir un archivo NIfTI
- Guardar el archivo. Guarda el archivo .nii o .nii.gz (y los archivos de máscara, si los hay) en Archivos o comparte un enlace.
- Importar. En Ossidex, toca + → Archivos y selecciona los archivos.
- Ver. Abre el volumen, selecciona un punto temporal si está disponible y agrega una máscara o un mapa compatible y alineado desde el panel de capas.
NIfTI y DICOM de un vistazo
| DICOM | NIfTI-1 / NIfTI-2 | |
|---|---|---|
| Uso habitual | Imagenología clínica y archivo | Investigación, análisis y flujos de trabajo de IA |
| Archivos por volumen | A menudo, uno por corte | Un archivo (.nii o .nii.gz) |
| Metadatos del paciente y del estudio | Amplios | Mínimos |
| Orientación | Etiquetas de posición/orientación por imagen | Matrices qform/sform |
| Segmentaciones | DICOM SEG, RTSTRUCT | Volúmenes de mapas de etiquetas |
Visores NIfTI por plataforma
| Visor | Plataforma | Precio | Ideal para |
|---|---|---|---|
| MRIcroGL | Windows, macOS, Linux | Gratis | Visualización y renderizado rápidos de volúmenes de investigación |
| ITK-SNAP | Windows, macOS, Linux | Gratis, de código abierto | Segmentación manual y semiautomática |
| 3D Slicer | Windows, macOS, Linux | Gratis, de código abierto | Segmentación, registro y análisis |
| FSLeyes | macOS, Linux (parte de FSL) | Gratis para uso no comercial | Resultados de análisis de neuroimagen |
| NiiVue / Papaya | Navegador web | Gratis, de código abierto | Visualización en el navegador sin instalar nada |
| Ossidex | iPhone, iPad | Descarga gratis; MPR y 3D requieren Pro | Visualización de volúmenes y máscaras en un teléfono o una tableta |
Las herramientas de investigación de escritorio siguen siendo las adecuadas para el análisis; Ossidex sirve para consultar un volumen o una segmentación sin computadora.
Cómo abrir archivos NIfTI paso a paso en iPad
- Reúne los archivos. Guarda el volumen de imagen y sus archivos de máscara en una misma carpeta en Archivos o comprímelos en un ZIP.
- Importa la carpeta. En Ossidex, toca + → Archivos y selecciona la carpeta o el archivo ZIP.
- Elige una capa. En el panel de capas, elige una máscara o un mapa continuo y confirma que esté alineado espacialmente. Activa o desactiva segmentos, o ajusta la opacidad y los umbrales del mapa.
Fuentes habituales de archivos NIfTI
| Fuente | Ejemplo |
|---|---|
| Investigación en neuroimagen | RM cerebral convertida desde DICOM con dcm2niix |
| Herramientas de segmentación | Mapas de etiquetas de 3D Slicer, ITK-SNAP o nnU-Net |
| Conjuntos de datos públicos | Conjuntos de datos de desafíos y colecciones de investigación abiertas |
| Flujos de trabajo de IA | Resultados de modelos guardados como máscaras junto al volumen de entrada |
Máscaras y mapas continuos como capas
Importa el volumen de imagen junto con su máscara o mapa ya alineado. Las capas de etiquetas conservan los ID enteros exactos de 0 a 4095; el fondo, con valor 0, es transparente y la visibilidad se controla por segmento. Los mapas continuos permiten ajustar el color, la opacidad y los umbrales. Puedes seleccionar hasta dos capas en planos 2D/MPR; las capas no se muestran en modo slab/MIP ni en el renderizado de volumen. Ossidex no realiza registros ni segmentaciones automáticos.
Series temporales NIfTI 4D
Selecciona un punto temporal para actualizar el volumen mostrado. El gráfico temporal opcional sigue el vóxel original situado en el punto de mira y, cuando está disponible, utiliza el intervalo temporal del archivo. Al tocar o deslizar el gráfico, se selecciona un fotograma. Esta herramienta sirve para visualizar, no para analizar fMRI ni para calcular promedios de regiones de interés (ROI).
Explicación breve de la orientación
El encabezado NIfTI almacena cómo se asignan los índices de los vóxeles al espacio del paciente (las matrices qform y sform). Los visores que las ignoran muestran el volumen invertido o girado. Ossidex aplica la transformación almacenada y etiqueta las direcciones correspondientes (izquierda/derecha, anterior/posterior y superior/inferior).
Limitaciones
La compatibilidad se limita a archivos NIfTI-1/2 de un solo archivo y escalares compatibles; no se pueden visualizar todos los tipos de componentes ni todos los resultados de investigación. El límite de importación de NIfTI descomprimidos es de 512 MiB. Por lo general, NIfTI contiene menos metadatos clínicos que DICOM, por lo que los estudios se identifican por el nombre del archivo. Para ver tus propios estudios en MPR, 3D y varios paneles, necesitas Pro; consulta Gratis y Pro. La aplicación no convierte NIfTI a DICOM.
Preguntas frecuentes
¿Puedo ver una segmentación de 3D Slicer o nnU-Net?
Sí, siempre que se exporte como un mapa de etiquetas NIfTI-1/2 compatible con ID enteros exactos de 0 a 4095. Importa también la imagen de referencia y confirma que los archivos ya estén alineados espacialmente; Ossidex no los registra ni los segmenta.
¿NIfTI es mejor que DICOM?
Sirven para propósitos distintos: DICOM es el estándar clínico y contiene metadatos completos; NIfTI es un formato de investigación compacto.
¿Puedo hacer mediciones en volúmenes NIfTI?
Sí. Las distancias se calculan en milímetros, según el tamaño de vóxel almacenado en el encabezado NIfTI, tanto en los cortes como en los planos MPR.
¿De dónde puedo obtener archivos NIfTI a partir de DICOM?
Herramientas de investigación como dcm2niix convierten series DICOM a NIfTI. Para visualizar estudios clínicos no necesitas convertirlos: Ossidex abre los archivos DICOM originales.
¿Puedo convertir NIfTI a DICOM en Ossidex?
No. Ossidex abre archivos NIfTI para visualizarlos y exporta imágenes o PDF, no archivos DICOM.
¿Hay que descomprimir primero los archivos .nii.gz?
No. Los archivos NIfTI comprimidos con gzip se leen directamente.
Fuentes
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