Przewodnik po formatach
Czym jest plik DICOM? Wyjaśnienie formatu obrazowania medycznego
DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) to międzynarodowy standard przechowywania i wymiany obrazów medycznych. Plik DICOM zawiera piksele obrazu oraz nagłówek z informacjami o pacjencie, badaniu i skanerze — takimi jak odstęp między pikselami i położenie warstwy — dzięki czemu przeglądarka może wykonywać pomiary w milimetrach i odtwarzać wolumeny 3D.
Co zawiera plik DICOM
- Nagłówek (elementy danych) — znaczniki, takie jak imię i nazwisko pacjenta (0010,0010), data badania, rodzaj obrazowania, odstęp między pikselami, grubość warstwy i położenie obrazu.
- Dane pikseli — sam obraz, zapisany bez kompresji lub w postaci skompresowanej (JPEG, JPEG 2000, JPEG-LS, RLE…).
- Unikatowe identyfikatory (UID) — łączą każdy obraz z jego serią i badaniem.
Badania, serie i obrazy
Badanie to jedno badanie obrazowe (na przykład „CBCT szczęki, 12 marca”). Może zawierać jedną lub więcej serii — badanie TK może obejmować rekonstrukcję tkanek miękkich i kości, a MRI ma osobną serię dla każdej sekwencji (T1, T2, FLAIR…). Każda seria to zestaw obrazów (warstw). Seria TK z 400 warstwami często składa się z 400 osobnych plików, niekiedy bez rozszerzenia.
Rozszerzenia plików
| Widoczna nazwa | Co to jest |
|---|---|
| .dcm / .dicom | Plik obrazu DICOM |
| Pliki bez rozszerzenia (IM00001, 1.2.840…) | Zwykle także DICOM — bardzo często spotykane na płytach |
| DICOMDIR | Indeks płyty: wskazuje, które pliki należą do danego pacjenta, badania i serii |
| .nii / .nii.gz | NIfTI, format badawczy do zapisu wolumenów — nie jest to DICOM, ale Ossidex go otwiera |
Jak otworzyć plik DICOM
Na komputerze potrzebujesz przeglądarki DICOM — aplikacje do zdjęć nie obsługują tego formatu. Na iPhonie lub iPadzie zainstaluj Ossidex, zapisz plik w aplikacji Pliki (lub użyj linku, z którego go otrzymano) i zaimportuj go. Instrukcja krok po kroku.
Prywatność
Ponieważ nagłówek zawiera dane pacjenta, pliki DICOM należy udostępniać ostrożnie. Ossidex umożliwia wyeksportowanie zanonimizowanej kopii.
Najważniejsze znaczniki DICOM i ich znaczenie
| Znacznik | Nazwa | Zastosowanie w przeglądarce |
|---|---|---|
| (0008,0060) | Rodzaj obrazowania | CT, MR, CR, DX, PX, IO… — wybiera ustawienia wstępne i narzędzia |
| (0020,000D) / (0020,000E) | UID badania / serii | Grupuje pliki w badania i serie |
| (0020,0032) / (0020,0037) | Położenie / orientacja obrazu | Porządkuje warstwy i tworzy wolumeny 3D |
| (0028,0030) | Odstęp między pikselami | Przelicza piksele na milimetry na potrzeby pomiarów |
| (0018,0050) | Grubość warstwy | Podawana dla serii; wpływa na jakość rekonstrukcji MPR |
| (0028,1052) / (0028,1053) | Przesunięcie / współczynnik reskalowania | Przelicza zapisane wartości na jednostki Hounsfielda w badaniach TK |
| (0028,1050) / (0028,1051) | Środek / szerokość okna | Domyślne ustawienia jasności i kontrastu |
Kompresja w plikach DICOM
Dane pikseli mogą być zapisane bez kompresji lub skompresowane z użyciem składni transferu: JPEG Baseline, JPEG Lossless, JPEG-LS, JPEG 2000, HTJ2K lub RLE. Płyty z aparatów dentystycznych CBCT i ośrodków obrazowania często wykorzystują JPEG 2000 lub JPEG Lossless, aby zmieścić dane na płycie CD. Ossidex dekoduje wszystkie te formaty na urządzeniu; pełna lista znajduje się na stronie formatów.
Gdy pliki DICOM są „uszkodzone”
Nie każdy plik określany jako DICOM jest zgodny ze standardem. Niektóre programy do nagrywania pomijają 128-bajtowy preambuł, niektóre programy eksportujące nie zapisują UID, a inne umieszczają migawki JPEG obok obrazów. Ossidex rozpoznaje pliki DICOM na podstawie zawartości, a nie nazwy pliku, i odzyskuje dane, o ile pozwala na to ich zawartość.
Najnowsze wersje obsługują też najczęstsze problemy z otwieraniem danych z rzeczywistych płyt: jeśli zamiast obrazów wybierzesz przeglądarkę Windows z płyty (.exe), Ossidex zaproponuje zaimportowanie całego folderu; pliki DICOM bez unikatowych identyfikatorów (UID) oraz obrazy JPEG bez rozszerzenia nadal można zaimportować; pliki pomocnicze dołączone do przeglądarki z płyty nie wywołują już prośby o hasło.
Pomoc w rozwiązaniu problemu z konkretnym plikiem lub importem
Często zadawane pytania
Czy mogę przekonwertować DICOM do JPG?
Tak — Ossidex eksportuje bieżący widok lub całą serię jako obrazy JPEG albo plik PDF. Pliki JPEG nie zawierają metadanych medycznych, dlatego zachowaj oryginalny plik DICOM w dokumentacji.
Dlaczego na mojej płycie są setki plików?
Serie TK i MRI zwykle zapisują każdą warstwę w osobnym pliku. Przeglądarka składa je z powrotem w całość.
Czy DICOM i DICOMDIR to to samo?
Nie. DICOMDIR to plik indeksu wskazujący obrazy DICOM na płycie. Więcej o DICOMDIR.
Czy DICOM służy wyłącznie do radiologii?
Nie. DICOM jest używany także w stomatologii (CBCT, pantomogramy i zdjęcia wewnątrzustne), kardiologii, okulistyce i weterynarii.
Czy plik DICOM może zawierać PDF?
Tak — obiekty Encapsulated PDF mogą zawierać opisy. Ossidex zachowuje je w badaniu.
Źródła
Related pages
DICOMDIR: co to jest i jak otworzyć go na iPhonie, iPadzie lub komputerze
DICOMDIR to plik indeksu badań obrazowych. Otwórz całą płytę na iPhonie, iPadzie, Macu lub PC, gdy DICOMDIR nie wyświetla obrazów.
Przeglądarka plików DCM: czym jest plik .dcm i jak otworzyć go na dowolnym urządzeniu
Czym jest plik .dcm i jak otworzyć go w Windows, Mac, przeglądarce lub na iPadzie? Przeglądarka DCM, konwersja DCM na JPG.
Ulepszony wieloklatkowy DICOM (TK i MR) na iPhonie i iPadzie
Jak Ossidex odczytuje geometrię i kalibrację klatek oraz serie 4D z plików DICOM w badaniach TK i MR na iPhonie i iPadzie.
Przeglądarka NIfTI na iPhone’a i iPada: otwieranie plików .nii i .nii.gz
Otwieraj pliki NIfTI-1/2 .nii i .nii.gz na iPhonie i iPadzie: wolumeny MRI, punkty czasowe 4D, MPR, mapy etykiet i ciągłe nakładki w Ossidex.
Otwieranie plików DICOM na iPhonie
Otwórz pliki .dcm i inne DICOM z Mail, AirDrop, iCloud Drive lub aplikacji Pliki. Ossidex to przeglądarka DICOM na iPhone’a i iPada.