Ossidex
简体中文
下载应用 支持

格式指南

NIfTI 查看器：在 iPhone 和 iPad 打开 .nii、.nii.gz

Ossidex 可在 iPhone 和 iPad 上打开单文件 NIfTI-1 和 NIfTI-2 体数据（.nii 和 gzip 压缩的 .nii.gz）。可通过 2D、MPR 和 3D 视图查看 MRI 或其他标量体数据，在兼容的 4D 文件中选择时间点，并在 2D/MPR 平面上查看标签图或连续型叠加图。应用会使用文件中存储的空间变换；导入时会对剪切网格进行重采样。浏览器查看器也可以在 2D 和 MPR 视图中打开兼容的标量 .nii 和 .nii.gz 体数据，并将 4D 时间点作为独立序列处理。3D、叠加图、体素时间曲线和剪切重采样仍是应用专属功能。

作者：Ossidex 团队 · 我们如何撰写和审核这些页面 · Updated

在 App Store 下载免费下载 · iPhone 和 iPad · iOS 17+
iPad 上 Ossidex 2.0 中的脑部 MRI，显示三个联动平面rtAttenPenn · Zenodo 3873446 · CC BY 4.0

什么是 NIfTI

NIfTI（神经影像信息技术倡议）是一种用于体数据的研究格式，广泛应用于神经影像和机器学习流程（例如分割结果）。与 DICOM 不同，一个 .nii 文件包含整个体数据，以及记录体素大小和方向的精简头信息，但患者或扫描仪信息很少。

支持情况

功能支持情况
NIfTI-1 和 NIfTI-2 单文件 .nii / .nii.gz支持
根据 sform/qform 确定方向会应用；对剪切网格进行重采样
4D 标量时间序列可选择帧，并绘制十字线所在体素的时间曲线
标签图 / 掩膜精确保留整数 ID 0–4095；可单独控制各分段的显示
连续型浮点叠加图颜色映射、透明度和阈值
叠加图定位2D/MPR 平面上最多可选两个图层；数据源必须已在空间上对齐

打开 NIfTI 文件

  1. 保存文件. 将 .nii 或 .nii.gz 文件（以及所有掩膜文件）放入“文件”App，或分享链接。
  2. 导入. 在 Ossidex 中轻点 + →“文件”，然后选择文件。
  3. 查看. 打开体数据；如有时间点，请先选择时间点，然后在图层面板中添加兼容且已对齐的掩膜或图谱。

NIfTI 与 DICOM 快速对比

DICOMNIfTI-1 / NIfTI-2
典型用途临床影像和归档研究、分析和 AI 流程
每组体数据的文件数通常每层一个文件一个文件（.nii 或 .nii.gz）
患者和检查元数据详尽较少
方向信息每幅图像的位置/方向标签qform/sform 矩阵
分割DICOM SEG、RTSTRUCT标签图体数据

各平台的 NIfTI 查看器

查看器平台价格适用场景
MRIcroGLWindows、macOS、Linux免费快速查看和渲染科研影像体数据
ITK-SNAPWindows、macOS、Linux免费、开源手动和半自动分割
3D SlicerWindows、macOS、Linux免费、开源分割、配准与分析
FSLeyesmacOS、Linux（FSL 的组成部分）非商业用途免费神经影像分析结果
NiiVue / Papaya网页浏览器免费、开源无需安装，直接在浏览器中查看
OssidexiPhone、iPad内置示例；适用 App Store 条款在手机或平板电脑上查看影像体数据和掩膜

桌面科研工具仍是进行分析的合适选择；Ossidex 适合在离开电脑时查看影像体数据或分割结果。

在 iPad 上逐步打开 NIfTI 文件

  1. 整理文件. 将图像体数据及其掩膜文件放在“文件”App 的同一文件夹中，或将它们压缩成 ZIP 文件。
  2. 导入文件夹. 在 Ossidex 中轻点 + →“文件”，然后选择文件夹或 ZIP 文件。
  3. 选择图层. 在图层面板中选择掩膜或连续型图谱，并确认其空间位置已对齐。可切换各分段的显示状态，或调整图谱的透明度和阈值。

常见的 NIfTI 文件来源

来源示例
神经影像研究使用 dcm2niix 将脑部 MRI 从 DICOM 转换而来
分割工具来自 3D Slicer、ITK-SNAP 或 nnU-Net 的标签图
公开数据集挑战赛数据集和开放研究数据集
AI 流程模型输出以掩膜形式保存在输入体数据旁边

将掩膜和连续型图谱作为图层

导入图像体数据及其已对齐的掩膜或图谱。标签图层会精确保留 0 到 4095 的整数 ID，背景值 0 为透明，并可单独控制各分段的显示。连续型图谱支持颜色、透明度和阈值调节。您可以在 2D/MPR 平面上选择最多两个图层；在层厚/MIP 或体绘制视图中不会显示图层。Ossidex 不执行自动配准或分割。

4D NIfTI 时间序列

选择时间点以更新显示的体数据。可选时间曲线会追踪十字线所在位置的原始体素，并在文件提供时间间隔信息时使用该信息。轻点或拖动曲线即可选择帧。这是一个查看工具，不用于 fMRI 分析或 ROI 平均值计算。

简要说明方向信息

NIfTI 头信息中保存了体素索引与患者空间之间的映射关系（qform 和 sform 矩阵）。忽略这些信息的查看器可能会将体数据显示为翻转或旋转状态。Ossidex 会应用文件中存储的变换，并据此标注方向（左/右、前/后、上/下）。

限制

仅支持兼容的标量单文件 NIfTI-1/2；并非所有组件类型或研究数据都能显示。展开后的 NIfTI 导入上限为 512 MiB。NIfTI 通常包含的临床元数据少于 DICOM，因此检查名称取自文件名。查看您自己的检查时，MPR、3D 和多面板功能需要 Pro；请参阅 免费版和 Pro 版。应用无法将 NIfTI 转换回 DICOM。

常见问题

我可以查看来自 3D Slicer 或 nnU-Net 的分割结果吗？

可以，但必须导出为受支持的 NIfTI-1/2 标签图，且整数 ID 必须为 0 到 4095。请同时导入参考图像，并确认文件在空间上已对齐；Ossidex 不会为您进行配准或分割。

NIfTI 比 DICOM 更好吗？

两者用途不同：DICOM 是包含完整元数据的临床标准；NIfTI 是一种紧凑的研究格式。

我可以测量 NIfTI 体数据吗？

可以。在切片和平面 MPR 视图中，距离会根据 NIfTI 头信息中存储的体素大小以毫米为单位计算。

如何从 DICOM 获取 NIfTI 文件？

dcm2niix 等研究工具可以将 DICOM 序列转换为 NIfTI。临床查看无需转换，Ossidex 可以直接打开原始 DICOM。

我可以在 Ossidex 中将 NIfTI 转回 DICOM 吗？

不可以。Ossidex 可打开 NIfTI 文件供查看，并可导出图像或 PDF，但不能导出 DICOM。

需要先解压 .nii.gz 吗？

不需要。应用可直接读取 gzip 压缩的 NIfTI 文件。

来源

Related pages

下载应用 — 免费