Biçim kılavuzu
iPhone ve iPad için NIfTI görüntüleyici: .nii ve .nii.gz dosyalarını açın
Ossidex, iPhone ve iPad’de tek dosyalı NIfTI-1 ve NIfTI-2 hacimlerini (.nii ve gzip ile sıkıştırılmış .nii.gz) açar. MR veya diğer skaler hacimleri 2D, MPR ve 3D olarak görüntüleyin; uyumlu 4D dosyalarda zaman noktalarını seçin ve 2D/MPR düzlemlerindeki etiket haritalarını veya sürekli örtüşmeleri inceleyin. Uygulama, dosyada kayıtlı uzamsal dönüşümü kullanır; kesme içeren ızgaralar içe aktarma sırasında yeniden örneklenir. Tarayıcı görüntüleyici de uyumlu skaler .nii ve .nii.gz hacimlerini 2D ve MPR olarak, 4D zaman noktalarını ise ayrı seriler halinde açar. 3D, örtüşmeler, voksel zaman grafikleri ve kesme için yeniden örnekleme yalnızca uygulamada bulunur.
rtAttenPenn · Zenodo 3873446 · CC BY 4.0NIfTI nedir?
NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative), hacimsel veriler için geliştirilmiş ve nörogörüntüleme ile makine öğrenmesi işlem hatlarında (ör. segmentasyon çıktılarında) yaygın olarak kullanılan bir araştırma biçimidir. DICOM’dan farklı olarak tek bir .nii dosyası, tüm hacmi ve voksel boyutu ile yönelim bilgilerini içeren kompakt bir başlığı barındırır; ancak hasta veya tarayıcı hakkında çok az ayrıntı içerir.
Desteklenen özellikler
| Özellik | Durum |
|---|---|
| Tek dosyalı NIfTI-1 ve NIfTI-2 .nii / .nii.gz | Evet |
| sform/qform’dan yönelim bilgisi | Uygulanır; kesme içeren ızgaralar yeniden örneklenir |
| 4D skaler zaman serileri | Kare seçimi ve imleçteki vokselin zaman grafiği |
| Etiket haritaları / maskeler | 0–4095 aralığında tam sayı kimlikleri; her segment için görünürlük ayarı |
| Sürekli kayan noktalı örtüşmeler | Renk haritaları, opaklık ve eşik ayarları |
| Örtüşmelerin yerleşimi | 2D/MPR düzlemlerinde seçilen en fazla iki katman; kaynakların uzamsal olarak önceden hizalanmış olması gerekir |
NIfTI dosyası açma
- Dosyayı kaydedin. .nii veya .nii.gz dosyasını (ve varsa maske dosyalarını) Dosyalar’a ekleyin ya da bir bağlantı paylaşın.
- İçe aktar. Ossidex’te + → Dosyalar’a dokunun ve dosyaları seçin.
- Görüntüle. Hacmi açın, varsa bir zaman noktası seçin ve katmanlar panelinden uyumlu, hizalanmış bir maske veya harita ekleyin.
NIfTI ve DICOM karşılaştırması
| DICOM | NIfTI-1 / NIfTI-2 | |
|---|---|---|
| Yaygın kullanım | Klinik görüntüleme ve arşivleme | Araştırma, analiz ve yapay zekâ işlem hatları |
| Hacim başına dosya sayısı | Genellikle her kesit için bir dosya | Tek dosya (.nii veya .nii.gz) |
| Hasta ve tetkik üst verileri | Kapsamlı | Asgari düzeyde |
| Yönelim | Her görüntü için konum/yönelim etiketleri | qform/sform matrisleri |
| Segmentasyonlar | DICOM SEG, RTSTRUCT | Etiket haritası hacimleri |
Platformlara göre NIfTI görüntüleyiciler
| Görüntüleyici | Platform | Fiyat | En uygun kullanım alanı |
|---|---|---|---|
| MRIcroGL | Windows, macOS, Linux | Ücretsiz | Araştırma hacimlerini hızlıca görüntüleme ve işleme |
| ITK-SNAP | Windows, macOS, Linux | Ücretsiz, açık kaynaklı | Elle ve yarı otomatik segmentasyon |
| 3D Slicer | Windows, macOS, Linux | Ücretsiz, açık kaynaklı | Segmentasyon, kayıt ve analiz |
| FSLeyes | macOS, Linux (FSL'nin parçası) | Ticari olmayan kullanım için ücretsiz | Nörogörüntüleme analiz çıktısı |
| NiiVue / Papaya | Web tarayıcısı | Ücretsiz, açık kaynaklı | Kurulum yapmadan tarayıcıda görüntüleme |
| Ossidex | iPhone, iPad | Yerleşik örnekler; App Store koşulları | Hacimleri ve maskeleri telefonda veya tablette görüntüleme |
Masaüstü araştırma araçları analiz için en doğru seçenektir; Ossidex ise bilgisayardan uzaktayken bir hacmi veya segmentasyonu görüntülemek içindir.
iPad’de NIfTI dosyalarını adım adım açma
- Dosyaları bir araya getirin. Görüntü hacmini ve maske dosyalarını Dosyalar’da aynı klasöre koyun veya ZIP dosyası oluşturun.
- Klasörü içe aktarın. Ossidex’te + → Dosyalar’a dokunun ve klasörü veya ZIP dosyasını seçin.
- Katman seçin. Katmanlar panelinde bir maske veya sürekli harita seçin ve uzamsal hizalamayı doğrulayın. Segmentlerin görünürlüğünü açıp kapatın veya haritanın opaklık ve eşik ayarlarını düzenleyin.
Yaygın NIfTI kaynakları
| Kaynak | Örnek |
|---|---|
| Nörogörüntüleme araştırmaları | dcm2niix ile DICOM’dan dönüştürülmüş beyin MR görüntüsü |
| Segmentasyon araçları | 3D Slicer, ITK-SNAP veya nnU-Net ile oluşturulmuş etiket haritaları |
| Kamuya açık veri kümeleri | Yarışma veri kümeleri ve açık araştırma koleksiyonları |
| Yapay zekâ işlem hatları | Girdi hacminin yanına maske olarak kaydedilen model çıktıları |
Katman olarak maskeler ve sürekli haritalar
Görüntü hacmini, önceden hizalanmış maskesi veya haritasıyla birlikte içe aktarın. Etiket katmanları 0–4095 aralığındaki tam sayı kimliklerini aynen korur; arka plan olan 0 saydamdır ve her segmentin görünürlüğü ayrı ayrı ayarlanabilir. Sürekli haritalarda renk, opaklık ve eşik kontrolleri bulunur. 2D/MPR düzlemlerinde en fazla iki katman seçebilirsiniz; katmanlar slab/MIP veya hacim oluşturma görünümlerinde gösterilmez. Ossidex otomatik eşleştirme veya segmentasyon yapmaz.
4D NIfTI zaman serileri
Görüntülenen hacmi güncellemek için bir zaman noktası seçin. İsteğe bağlı zaman grafiği, imleçteki özgün vokseli izler ve dosyada varsa zaman aralığı bilgisini kullanır. Grafiğe dokunarak veya grafikte kaydırma yaparak bir kare seçebilirsiniz. Bu özellik görüntüleme içindir; fMRI analizi veya ROI ortalaması hesaplama iş akışı değildir.
Yönelim hakkında kısa açıklama
NIfTI başlığı, voksel indekslerinin hasta koordinat sistemindeki konumlarla nasıl eşleştiğini (qform ve sform matrislerini) kaydeder. Bu bilgileri dikkate almayan görüntüleyiciler hacmi ters veya döndürülmüş gösterebilir. Ossidex, kayıtlı dönüşümü uygular ve yönleri (sol/sağ, ön/arka, üst/alt) buna göre etiketler.
Sınırlamalar
Yalnızca uyumlu, skaler ve tek dosyalı NIfTI-1/2 dosyaları desteklenir; her bileşen türü veya araştırma çıktısı görüntülenemez. Genişletilmiş NIfTI içe aktarma sınırı 512 MiB’dir. NIfTI, genellikle DICOM’dan daha az klinik üst veri içerdiğinden tetkikler dosya adıyla tanımlanır. Kendi tetkiklerinizde MPR, 3D ve çok panelli görüntüleme için Pro gerekir; Ücretsiz ve Pro sayfasına bakın. Uygulama NIfTI’yi DICOM’a dönüştürmez.
Sık sorulan sorular
3D Slicer veya nnU-Net’ten alınan bir segmentasyonu görüntüleyebilir miyim?
Evet. Desteklenen, 0–4095 aralığında tam sayı kimlikleri içeren bir NIfTI-1/2 etiket haritası olarak dışa aktarılmış olması gerekir. Referans görüntüyü de içe aktarın ve dosyaların uzamsal olarak önceden hizalanmış olduğunu doğrulayın; Ossidex bunları sizin için eşleştirmez veya segmente etmez.
NIfTI, DICOM’dan daha mı iyidir?
Farklı amaçlara hizmet ederler: DICOM, tüm üst verileri içeren klinik standarttır; NIfTI ise kompakt bir araştırma biçimidir.
NIfTI hacimlerinde ölçüm yapabilir miyim?
Evet. Kesitlerde ve MPR düzlemlerinde mesafeler, NIfTI başlığında kayıtlı voksel boyutu kullanılarak milimetre cinsinden hesaplanır.
DICOM görüntülerinden NIfTI dosyalarını nasıl elde edebilirim?
dcm2niix gibi araştırma araçları DICOM serilerini NIfTI’ye dönüştürür. Klinik görüntüleme için dönüştürmeniz gerekmez — Ossidex özgün DICOM dosyasını açar.
Ossidex’te NIfTI’yi tekrar DICOM’a dönüştürebilir miyim?
Hayır. Ossidex, NIfTI dosyalarını görüntülemek için açar ve görüntüleri veya PDF’yi dışa aktarır; DICOM dışa aktarmaz.
.nii.gz dosyasını önce açmam gerekir mi?
Hayır. Gzip ile sıkıştırılmış NIfTI dosyaları doğrudan okunur.
Kaynaklar
Related pages
Desteklenen biçimler: DICOM, NIfTI, görüntüler, modeller ve arşivler
iPhone ve iPad’de Ossidex biçimleri: DICOM BT, MR, CBCT ve ultrason; NIfTI-1/2; görüntüler; PDF; STL/PLY/OBJ modelleri ve ZIP, RAR, 7z, ISO arşivleri.
iPhone ve iPad’de MPR ve 3D hacim görüntüleme
BT, CBCT ve MR'da bağlantılı artı işaretleri, oblik düzlemler, slab MIP ve çok düzlemli rekonstrüksiyon; hazır ayarlarla 3D hacim görüntüleme.
Telefonunuzda MR görüntüleyin
Ossidex 2.0’daki beyin MR demosunu keşfedip kendi tetkikinizi açın. Serileri, MPR’yi ve görüntülerin size neler söyleyemeyeceğini öğrenin.
Radyologlar
İş istasyonundan uzaktayken BT ve MR görüntülerini hızla inceleyin; DICOMweb üzerinden PACS’e bağlanın, MPR ve 3D’den yararlanın.